Kentte 1965 yılında kurulan ve geçmişte gösterdiği başarılarla “Anadolu efsanesi” olarak anılan Eskişehirspor, uzun yıllar Harika Lig’de yer aldı.

Eskişehir temsilcisi, 1981-1982 döneminde bir alt lige düşerek 1988-1989 dönemine kadar TFF 2. Lig’de uzunluk gösterdi. 1988-1989’da tekrar Muhteşem Lig’de çaba eden siyah-kırmızılı kadro, bir sonraki dönem sonunda bir alt lige düştü.

TFF 1. Lig’de 1994-1995 dönemine kadar çaba eden Eskişehir temsilcisi, 1995-1996’da uzunluk gösterdiği Üstün Lig’e tıpkı devirde veda etti.

1999-2000, 2000-2001 dönemlerinde TFF 1. Lig’de kenti temsil eden Eskişehirspor; 2001-2002, 2002-2003, 2003-2004, 2005-2006’yı ise TFF 2. Lig’de geçirdi.

2006-2007 döneminde bir üst lig olan TFF 1. Lig’de yer alan siyah-kırmızılı takım, 2007-2008’de de bu ligde uzunluk gösterdi.

Eskişehirspor, 2007-2008 döneminde 1. Lig play-off finalinde Boluspor’u yenerek, Harika Lig’e çıktı.

Siyah-kırmızılılar, 2011-2012 dönemin ikinci devresinde Ersun Yanal formülünde ligi 4’üncü sırada tamamlayıp UEFA Avrupa Ligi elemelerine katılma hakkı kazandı. 2015-2016 döneminde Harika Lig’i 17’inci tamamlayan Eskişehirspor TFF 1. Lig’e düştü. 2020-2021 dönemine kadar bu ligde uğraş veren Eskişehir temsilcisi evvel 2. Lig’e, 2021-2022 döneminde ise 3. Lig’e düştü.

TFF 3. Lig’de iki dönem sonunda Eskişehirspor, alanında karşılaştığı Elazığ temsilcisine 6-3 kaybederek Bölgesel Amatör Lig’e geriledi.